O Centro de Ecologia e Conservação Animal (ECOA) desenvolve programas de monitoramento de comunidades animais e vegetais em várias regiões do Estado da Bahia e possui convênios com instituições públicas e privadas, com o objetivo de fortalecer a formação de seus pesquisadores e repassar o conhecimento produzido e os resultados alcançados às comunidades científicas e à sociedade.

Os projetos desenvolvidos em nível local e regional incluem as seguintes ações:

- Proposição de atividades para a conservação da fauna do Parque Metropolitano de Pituaçu, do Município de Mucugê e da Restinga do Litoral Norte;

- Organização de uma coleção científica de referência para a fauna e flora local e regional;

- Manutenção de um banco de dados científicos com centenas de títulos;

- Promoção de cursos, palestras e treinamentos relacionados à conservação ambiental;

- Assistência aos graduandos do Curso de Biologia em projetos voltados à Ecologia;

- Identificação, juntamente com o Ministério do Meio Ambiente/IBAMA e ICMBio de novas Áreas Prioritárias para Conservação no Estado da Bahia.

Além de parcerias nacionais para o desenvolvimento das suas atividades (com a Lacerta Ambienta, IBAMA, ICMBio, Instituto Butatã, Laboratório de Mirmecologia da CEPLAC), o Programa mantém parcerias internacionais com o Amphibian Ark e a Durrell Wildlife Conservation Trust, no Reino Unido, e com o Durrell Institute for Conservation Ecology (DICE), da Universidade de Kent, Reino Unido.